Indépendant et profession libérale : quel logiciel de facturation électronique en 2026 ?

TVA, franchise ou actes exonérés : trois situations, une réception commune

La réforme s’applique aux assujettis à la TVA établis en France, ce qui recouvre trois situations fréquentes chez les indépendants. Le professionnel redevable de la TVA doit pouvoir recevoir les factures électroniques de ses fournisseurs depuis le 1er septembre 2026 et devra émettre sous ce format à partir du 1er septembre 2027 pour ses clients professionnels assujettis établis en France. Le professionnel en franchise en base reste assujetti : mêmes dates, sans TVA sur ses documents, avec un e-reporting bimestriel pour ses opérations concernées.

Le professionnel dont certaines opérations sont exonérées au titre des articles 261 à 261 E du CGI, ce qui concerne notamment certaines professions de santé, n’est soumis pour ces opérations ni à l’émission électronique ni à l’e-reporting ; il reste assujetti et doit donc pouvoir recevoir les factures électroniques de ses fournisseurs. Une activité taxable exercée à côté suit le calendrier général et se traite séparément. Faites confirmer ces qualifications par votre expert-comptable ou votre association de gestion agréée. Le ministère a annoncé le 1er septembre 2026 qu’aucune sanction ne serait appliquée pendant le démarrage, jusqu’en 2027 ; les barèmes du CGI demeurent, avec 50 € par facture non émise électroniquement quand elle doit l’être, dans la limite de 15 000 € par an.

BNC, déclaration de résultat et comptabilité : tout dépend de l’offre

Un indépendant en BNC au réel tient une comptabilité de recettes et de dépenses et dépose chaque année sa déclaration de résultat, le formulaire 2035, en plus de ses déclarations de TVA s’il en est redevable. L’e-reporting ne se substitue à aucune de ces déclarations. La question est de savoir qui les produit : vous, avec un outil qui les automatise, ou votre cabinet, à partir des données que l’outil lui prépare.

Chez Indy, l’offre Premium pour une entreprise individuelle en BNC à l’impôt sur le revenu est affichée à partir de 22 € HT par mois en annuel, 28 € en mensuel, avec des déclarations fiscales automatisées pour les activités éligibles ; les activités BIC doivent vérifier leur compatibilité. Pour une société unipersonnelle à l’IS, Premium est à 49 € en annuel et l’option Expert-comptable ajoute la validation par un partenaire dès 108 €. Tiime, Qonto et Axonaut préparent les données pour votre cabinet ; Pennylane devient un outil de production commun lorsque le cabinet y travaille ; Odoo tient une comptabilité complète dans sa suite payante. Les honoraires restent distincts de l’abonnement dans tous les cas.

Notes d’honoraires, clients professionnels et patientèle

Le nom du document ne change pas la nature de l’opération. Une note d’honoraires adressée à un client professionnel assujetti établi en France pour une prestation taxable entre dans le circuit de la facture électronique à partir de votre obligation d’émission, avec les mêmes mentions et le même passage par une plateforme agréée qu’une facture. Un PDF envoyé par e-mail ne suffira plus pour ces opérations.

Vos clients particuliers ou vos patients continuent de recevoir leurs notes sous la forme habituelle. Pour les prestations taxables, leurs données de transaction sont transmises par e-reporting, sans identification du client ; pour les actes exonérés, ni émission ni e-reporting ne sont dus. Vérifiez aussi les mentions de vos documents : « EI » ou « Entrepreneur individuel » accolée à votre nom, mention de franchise le cas échéant et, pour les adhérents d’une association agréée, la mention relative à l’acceptation des règlements par chèque et carte bancaire. Notre vérificateur de mentions obligatoires reprend ces cas.

Le lien avec le cabinet ou l’association agréée

Les éditeurs documentent l’accès du cabinet de façons très différentes. Tiime ouvre un accès gratuit au comptable dès Free, limité aux données de facturation électronique, puis ajoute transactions et justificatifs dans Smart, à 17,99 € HT par mois en annuel pour 0 à 1 salarié. Pennylane partage le même dossier que le cabinet lorsqu’il produit sur la plateforme, hors Free. Qonto propose un accès comptable et des exports, réservés dans l’offre gratuite aux clients Regate by Qonto. Axonaut fournit une pré-comptabilité et des exports ; chez Odoo, l’accès est un accès utilisateur limité aux applications de l’offre ; chez Indy, le compte est personnel et l’accès d’un expert-comptable partenaire passe par une option payante.

Avant de choisir, demandez à votre cabinet ou à votre association agréée quelles pièces il attend, dans quel format et à quel rythme, puis testez un export fictif avec lui : disposer d’un export ne garantit pas une reprise complète dans son logiciel. Si vous travaillez seul avec un outil qui automatise vos déclarations, conservez la possibilité de transmettre un dossier propre le jour où vous voudrez déléguer.

Facturer seul : relances, signature des devis et compte pro

Pour un indépendant, un seul accès suffit presque toujours, et les offres gratuites en donnent un : Indy Essentiel, Tiime Free et Qonto Facturation. Les différences portent sur ce qui entoure la facture. La relance d’un impayé est possible en un clic dans Tiime Free et incluse dans Qonto Facturation ; les relances automatiques relèvent d’Indy Plus, à 9 € HT par mois en annuel, ou de Pennylane Essentiel, à 24 €. La signature électronique des devis est dans Indy Plus, dans Tiime Business à 24,99 € en annuel, dans Pennylane Essentiel et dans un module payant chez Qonto.

Le compte professionnel est un choix distinct. Qonto en fait le cœur de son offre, avec Basic à 9 € en annuel pour une carte et 30 virements par mois ; Indy le propose en option, Tiime dans Smart ou Business sous conditions, Pennylane dès Starter avec activation obligatoire pour ce palier. Aucune offre gratuite du tableau ne vous oblige à ouvrir un compte pour facturer. Axonaut, à 97 € sans engagement ou 58,20 € en annuel, réunit CRM, devis, relances et factures récurrentes : ce périmètre se justifie pour un consultant qui suit des prospects et des projets, rarement pour facturer seul.

Le coût sur douze mois, un cas fictif et les avantages lecteurs

Comparez le même mode de paiement et le prix après la première année : Qonto affiche ses prix en annuel, Pennylane n’affiche pas de tarif annuel, Tiime facture ses offres payantes annuellement et Odoo Standard passe de 19,90 € à 24,90 € par utilisateur après douze mois. Notre simulateur reprend ces grilles pour les statuts « EI à l’impôt sur le revenu », « Micro-entreprise sans TVA » ou « Société unipersonnelle », et le duel Indy–Tiime détaille trois budgets annuels selon ce que vous voulez automatiser.

Prenons une consultante en entreprise individuelle, en BNC au réel et redevable de la TVA, qui adresse une quarantaine de notes d’honoraires par an à des entreprises et travaille avec un cabinet. Trois montages se comparent sur douze mois : Indy Premium à partir de 22 € par mois en annuel si elle veut automatiser ses déclarations ; Tiime Smart à 17,99 € si le cabinet produit à partir des transactions et justificatifs partagés ; Qonto Facturation gratuit, avec ou sans compte Basic à 9 €, si le cabinet se contente d’exports et de justificatifs. Dans chaque cas, elle ajoute les honoraires et vérifie qui déclare la TVA et le résultat. Ce scénario illustre une méthode, pas un test produit réalisé par FactureMatch.

Trois avantages lecteurs vérifiés existent : via notre lien partenaire, Indy offre le premier mois de sa version payante, sans engagement, appliqué automatiquement par le lien, sans code à saisir ; Axonaut offre un mois aux nouveaux clients inscrits via notre lien partenaire, après le premier achat, appliqué automatiquement par le lien ; Tiime offre un mois sur Smart et Business avec le code FACTUREMATCH3, à saisir par le lecteur, valable jusqu’au 30 septembre 2027. Aucun de ces avantages n’ajoute de point à la note et ils n’ont aucun effet sur le classement ni sur l’ordre du tableau.